TY - JOUR T1 - Evolutionary evaluation of the dominant genetic haplotype of SARS-CoV-2 virus in Iran from June to November 2020 TT - ارزیابی تکاملی هاپلوتایپ‌های ژنتیکی غالب ویروس SARS-CoV-2 در ایران در بازه زمانی خرداد تا آبان 1399 JF - J-Police-Med JO - J-Police-Med VL - 11 IS - 1 UR - http://jpmed.ir/article-1-1064-fa.html Y1 - 2022 SP - 1 EP - 14 KW - SARS-CoV-2 KW - COVID-19 KW - Coronavirus Mutation KW - Haplotypes KW - Single Nucleotide Polymorphism N2 - اهداف: مطالعات اولیه تغییرات نوکلئوتیدی درتوالی‌های ژنومی ویروس، منجر به شناسایی 13 گروه هاپلوتایپی شده است. از بین این هاپلوتایپ‌ها موارد H1، H2 و H5 بیشترین فراوانی را در دنیا نشان داده‌اند. بنابراین تغییرات برچسب تک‌نوکلئوتیدی، در این هاپلوتایپ‌ها با استفاده از روش PCR در جمعیت ایرانی ارزیابی شد. مواد و روش‌ها: نمونه‌های RNA این مطالعه مقطعی از افرادی که در بازه زمانی خرداد تا آبان سال 1399 به یکی از آزمایشگاه‌های تشخیصی ناجا در شهر تهران مراجعه کرده بودند و ابتلای آنها به COVID-19 به وسیله تست PCR تأیید شده بود، گرفته شد. 300 نمونه به روش تصادفی انتخاب شدند. به منظور شناسایی و تعیین فراوانی تغییرات برچسب تک‌نوکلئوتیدی موجود در هاپلوتایپ‌های H1،H2 و H5 تمام نمونه‌ها با استفاده از رویکرد ARMS-PCR ارزیابی شدند. جهت کسب اطمینان از صحت نتایج ARMS-PCR تعدادی از نمونه‌ها به روش Sanger، توالی‌یابی شدند. یافته‌ها: تعیین ژنوتیپ نمونه‌های ژنومی نشان داد، 122 نمونه دارای جهش شاخص گروه هاپلوتایپی H5 (28688T>C) و 158 نمونه دارای جهش شاخص گروه هاپلوتایپی H1 (14408C>T) بودند. همچنین مشاهده شد که 11 نمونه همزمان با دو هاپلوتایپ ویروسی متفاوت آلوده شده بودند. به علاوه در نمونه‌های مورد بررسی گروه هاپلوتایپی H2 مشاهده نشد. نتیجه‌گیری: ارزیابی‌ها حکایت از آن دارد که جمعیت غالب ویروس‌های آلوده‌کننده افراد ایرانی در اوایل همه‌گیری دارای هاپلوتایپ H5 بودند. به دنبال گسترش قابل توجه گروه هاپلوتایپی H1 در سطح جهان و با گذشت زمان، این گروه به عنوان هاپلوتایپ غالب جایگزین H5 گردید. توالی‌های از نوع H1 واجد تغییرات مهمی در دو ژن RdRp و S بودند که به ترتیب در تکثیر ژنوم ویروس و اتصال به سلول میزبان نقش داشتند. M3 10.30505/11.1.14 ER -