مقدمه: مدیریت بهینه انواع پسماندهای مراکز بهداشتی به دلیل نقش عمده آن‌ها در انتشار عوامل بیماری‌زا و تهدید سلامت انسان و محیط‌زیست از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. این مطالعه با هدف تعیین وضعیت مدیریت و کمیت و آنالیز فیزیکی پسماندهای مراکز بهداشتی درمانی منتخب یکی از نیروهای نظامی انجام گرفت. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی، وضعیت مدیریت پسماندها با استفاده از چک‌لیست محقق ساخته که روایی و پایایی آن سنجیده شده، تعیین گردید. کمیت پسماندها با توزین و آنالیز فیزیکی به کمک نیروهای آموزش‌دیده انجام شد. داده‌های جمع‌آوری‌شده با استفاده از نرم‌افزار SPSS 16 و آزمون t-test مورد تجزیه‌وتحلیل قرار گرفت. یافته ها: وضعیت مدیریت پسماندهای شبه خانگی، عفونی، دندانپزشکی و تیز و برنده درمانگاه A در وضعیت غیرقابل‌قبول و در درمانگاه B به ترتیب متوسط، ضعیف، غیرقابل‌قبول و خوب ارزیابی شدند. در مراکز فوق به ترتیب میانگین سرانه کل پسماندها g/day 24/99 و 28/97، سرانه پسماندهای تیز و برنده g/day1/89 و 2/17 و سرانه پسماندهای دندانپزشکی g/day 149/58 و 159/09 به دست آمد. در بین موارد فوق فقط اختلاف میانگین سرانه پسماندهای تیز و برنده بین دو درمانگاه معنی‌دار بود (0/05 < P). نتیجه گیری: با توجه به نتایج به‌دست‌آمده، وضعیت مدیریت پسماندهای مراکز بهداشتی درمانی منتخب در حد مطلوب نبود. ارتقاء سلامت کارکنان و بهبود وضعیت بهداشتی این درمانگاه‌ها مستلزم آموزش کارکنان و توجه جدی به مدیریت بهینه انواع پسماندها و رعایت مقررات بهداشتی و حمایت مسئولین است.